Модель вируса ковид 19 своими руками

Обновлено: 07.01.2025

В настоящее время не существует проверенных эффективных методов лечения этого вируса. Быстро расширяющиеся знания о вирусологии SARS-CoV-2 обеспечивают значительное число потенциальных мишеней для лекарств. Наиболее перспективной терапией является ремдесивир. Ремдесивир обладает сильной активностью invitro против SARS-CoV-2, но он не одобрен Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США и в настоящее время проходит тестирование в текущих рандомизированных исследованиях. Озелтамивир не показал эффективности, и в настоящее время не рекомендуется применение кортикостероидов. Современные клинические данные не подтверждают необходимость прекращения действия ингибиторов ангиотензин-превращающего фермента или блокаторов рецепторов ангиотензина у пациентов с COVID-19.

ВАЖНО. Пандемия коронавирусной болезни 2019 года (COVID-19), вызванной новым очень острым респираторным синдромом коронавирусом 2 (SARS-CoV-2), представляет собой беспрецедентную проблему для определения эффективных лекарств для профилактики и лечения. Учитывая быстрые темпы научных открытий и клинических данных, полученных большим количеством людей, быстро инфицированных SARS-CoV-2, клиницисты нуждаются в точных доказательствах относительно эффективности лечения этой инфекции.

Методы.

SARS-CoV-2: вирусологические и лекарственные мишени

SARS-CoV-2, вирус с одноцепочечной РНК-оболочкой, воздействует на клетки через белок вирусного структурного пика (S), который связывается с рецептором ангиотензинпревращающего фермента 2 (ACE2). После связывания рецептора вирусная частица использует рецепторы и эндосомы клетки-хозяина для проникновения в клетки. Трансмембранная серинпротеаза типа 2 хозяина, TMPRSS2, облегчает проникновение в клетку через белок S.3. Внутри клетки синтезируются вирусные полипротеины, которые кодируют комплекс репликаза-транскриптаза. Затем вирус синтезирует РНК через свою РНК-зависимую РНК-полимеразу. Структурные белки синтезируются, что приводит к завершению сборки и высвобождения вирусных частиц. Перспективные лекарственные средства включают в себя белки структурной структуры (например, 3-химотрипсин-подобную протеазу, папаин-подобную протеазу, РНК-зависимую РНК-полимеразу), которые разделяют гомологию с другими новыми коронавирусами (nCoVs). Дополнительные лекарственные мишени включают проникновение вируса и пути иммунорегуляции.

Текущие клинические испытания

Поисковые термины COVID ИЛИ коронавирус ИЛИ SARS-COV-2 на Clinical-Trials.gov привели к 351 активным испытаниям, 291 из которых были специфичны для COVID-19 по состоянию на 2 апреля 2020 года. Из этих 291 испытания примерно 109 испытаний (в том числе еще на стадии напбора пациентов, активных или завершенных) включали фармакологическую терапию для лечения КОВИД-19 у взрослых пациентов. Из этих 109 исследований 82 являются интервенционными с 29 плацебо-контролируемыми исследованиями. Согласно описанию исследований, существует 11 испытаний фазы 4, 36 фазы 3, 36 фазы 2 и 4 фазы 1. Двадцать два испытания не были классифицированы по фазе или не применимы.

Обзор отобранных повторно используемых лекарственных препаратов.

Препараты, ранее использовавшиеся для лечения SARS и MERS, являются потенциальными кандидатами на лечение COVID-19. Различные препараты с очевидной активностью in vitro против SARS-CoV и MERS-CoV использовались во время вспышек SARS и MERS, с недостоверной эффективностью. Мета-анализы исследований лечения SARS и MERS не выявили явного преимущества какой-либо конкретной схемы лечения.

Хлорохин и гидроксихлорохин

Хлорохин и гидроксихлорохин имеют давнюю историю в профилактике и лечении малярии и лечении хронических воспалительных заболеваний, включая системную красную волчанку (SLE) и ревматоидный артрит (RA). Хлорохин и гидроксихлорохин блокируют проникновение вируса в клетки путем ингибирования гликозилирование рецепторов хозяин, протеолитической обработки и эндосомального окисления. Они также проявляют иммуномодулирующие эффекты посредством ослабления продукции цитокинов и ингибирования аутофагии и лизосомальной активности в клетках хозяина. Хлорохин ингибирует SARS-CoV-2 in vitro с половинной максимальной эффективной концентрацией (EC 50) в низком микромолярном диапазоне. Гидроксихлорохин обладает активностью in vitro с более низким EC 50 для SARS-CoV-2 по сравнению с хлорохином после 24 часов роста (гидроксихлорохин: EC50 = 6,14 мкМ и хлорохин: EC50 = 23,90 мкМ). Нет качественных доказательств эффективности лечения хлорохином / гидроксихлорохином SARS или MERS. В ходе информационного брифинга из Китая сообщалось, что хлорохин был успешно использован для лечения серии из более чем 100 случаев COVID-19, в результате чего улучшились результаты рентгенологического исследования, улучшился вирусный клиренс и уменьшилось прогрессирование заболевания. Однако данные о клиническом дизайне и результатах еще не были представлены или опубликованы для рецензирования, что не позволяет подтвердить правильность этих утверждений. Недавнее открытое нерандомизированное французское исследование 36 пациентов (20 в группе гидроксихлорохина и 16 в контрольной группе) сообщили об улучшении вирусологического клиренса с гидроксихлорохином, 200 мг, внутрь каждые 8 часов по сравнению с контрольными пациентами, получавшими стандартную поддерживающую терапию. Вирусологический клиренс на 6-й день, измеренный мазками из носоглотки, составил 70% (14/20) против 12,5% (2/16) для гидроксихлорохина и контрольной группы соответственно (P = 0,001). Авторы также сообщили, что добавление азитромицина к гидроксихлорохину у 6 пациентов приводило к численно более высокому вирусному клиренсу (6/6, 100%) по сравнению с монотерапией гидроксихлорохином (8/14, 57%).

Несмотря на эти многообещающие результаты, это исследование имело несколько основных ограничений: небольшой размер выборки (только 20 в группе вмешательства и только 6 получали гидроксихлорохин и азитромицин); исключение из анализа 6 пациентов в группе гидроксихлорохина из-за раннего прекращения лечения в результате критического заболевания или непереносимости лекарств; вариабельные исходные вирусные нагрузки между группами, получавшими гидроксихлорохин и монотерапию; и не сообщалось ни о клинических результатах, ни о безопасности. Эти ограничения в сочетании с опасениями аддитивной кардиотоксичности при комбинированной терапии не поддерживают принятие этого режима без дополнительных исследований. Другое проспективное исследование 30 пациентов в Китае рандомизировало пациентов с гидроксихлорохином, (400 мг, ежедневно в течение 5 дней плюс стандартное лечение (поддерживающее лечение, интерферон и другие противовирусные препараты)) или только стандартное лечение 1: 1; - в вирусологическом исходе не было никакой разницы. На 7-й день вирусологический клиренс был сходным: 86,7% против 93,3% клиренса для группы гидроксихлорохин и группы стандартного ухода соответственно (P> 0,05).

В настоящее время существует несколько РКИ как хлорохина, так и гидроксихлорохина, исследующих их роль в COVID -19 лечение. В настоящее время существует несколько РКИ в отношении хлорохина, так и гидроксихлорохина, исследующих их роль в лечении COVID-19.

Дозировка хлорохина для лечения COVID-19 состояла из 500 мг перорально один или два раза в день. Тем не менее, существует недостаточно данных относительно оптимальной дозы для обеспечения безопасности и эффективности хлорохина. Рекомендации по дозированию гидроксихлорохина для SLE обычно 400 мг внутрь ежедневно. Тем не менее, физиологически обоснованное исследование фармакокинетического моделирования рекомендовало, чтобы оптимальным режимом дозирования гидроксихлорохина при лечении COVID-19 была нагрузочная доза 400 мг два раза в день в течение 1 дня, а затем 200 мг два раза в день. Напротив, альтернативные рекомендации сделаны для общей суточной дозы 600 мг на основе безопасности и клинического опыта при болезни Уиппла. Необходимы дальнейшие исследования, чтобы определить оптимальную дозу для COVID-19

Хлорохин и гидроксихлорохин относительно хорошо переносятся, что подтверждается обширным опытом пациентов с СКВ и малярией. Однако оба агента могут вызывать редкие и серьезные побочные эффекты (

Информацию из данного раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. В случае боли или иного обострения заболевания диагностические исследования должен назначать только лечащий врач. Для постановки диагноза и правильного назначения лечения следует обращаться к Вашему лечащему врачу.

Вирус в настоящее время известен как коронавирус 2 тяжелого острого респираторного синдрома (Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2 - SARS-CoV-2), и вызванное им заболевание называется коронавирусной болезнью 2019 (COronaVIrus Disease 2019 - COVID-19).

Коронавирусы – семейство РНК-содержащих вирусов, которые могут инфицировать как животных (крупного рогатого скота, птиц, собак), так и человека.

Вирусы, патогенные для животных, вызывают у них болезни печени, желудочно-кишечного тракта, повреждения мозга. Среди них наиболее изучен вирус инфекционного бронхита кур.

До 2002 года коронавирусы рассматривали в качестве агентов, которые могут вызывать нетяжелые заболевания верхних дыхательных путей. Смертельные исходы регистрировались крайне редко.

Семейство Coronaviridae содержит четыре рода вирусов:

Настоящая пандемия COVID19 вызвана вирусом SARS-Cov-2, который относится к роду β-коронавирусов. Инфицирование человека могут вызывать только альфа- и бетта- подтипы коронавируса.

Строение и размножение вирусов

Коронавирусы названы в соответствии с их внешним видом под электронным микроскопом. Вирусы выглядят так, как будто они покрыты остроконечными шипами, которые окружают их как корону.

Пути распространения

SARS-Cov-2 – относится к зооанторопонозным заболеваниям, то есть к заболеваниям общим для животных и человека. К этому же типу, в числе прочего, относят бешенство, лептоспироз, сибирскую язву, ящур.

Животные могут быть как резервуаром (естественной средой обитания вируса), так и источником инфекции при определенных условиях. По классификации Международного эпизоотического бюро (МЭБ) большинство коронавирусных инфекций относят к Типу 2+: болезни, передающиеся от диких животных домашним и человеку. Как известно, вспышка сегодняшней коронавирусной инфекции началась с рынка в китайском городе Ухань, на котором продаются морепродукты, летучие мыши, лягушки, змеи, птицы, сурки, кролики, и быстро поразила первых 50 человек.

Иными словами, первые пациенты получили вирус от животных, но масштаб пандемии COVID19 приобрел именно из-за передачи вирусной инфекции от человека к человеку.

Ключевые резервуары и способ передачи коронавирусов (предполагаемые резервуары SARS-CoV-2 обведены красным на рис. 2); только α и β коронавирусы обладают способностью инфицировать людей. Пунктирная черная стрелка показывает возможность переноса вируса из летучей мыши, тогда как сплошная черная стрелка обозначает подтвержденный перенос.

2012 год – вспышка ближневосточного респираторного синдрома, возбудителем которого также стал коронавирус, который получил название MERS-Cov. Во время вспышки было зафиксировано 2519 случаев заражения, из них более 860 со смертельным исходом. Вирус циркулирует по настоящее время, ежегодно регистрируются единичные случаи заболевания, вызываемые MERS-Cov.

Подробные исследования показали, что SARS-Cov передавался людям от циветт (хищных зверьков, дальних родственников кошки), а MERS-Cov – от одногорбых верблюдов. Генетическая последовательность нынешнего SARS-Cov-2 показала более 80% идентичности с SARS-CoV и 50% с MERS-CoV, причем как SARS-CoV, так и MERS-CoV происходят от летучих мышей. Существует вероятность того, что в передаче вируса человеку участвовал промежуточный хозяин. Более тщательный анализ показал, что по генам, кодирующим белки, SARS-Cov-2 ближе к коронавирусу змеи. Эти рептилии охотятся на летучих мышей, так что между ними вполне возможен обмен вирусами.

Понимание путей заражения и механизмов преодоления межвидового барьера очень важно для прогнозирования развития подобных вспышек эпидемий.

Приоритетные задачи расследования по идентификации животного источника обсуждались на заседании неформальной консультативной группы МЭБ по COVID-19 и были представлены на Глобальном форуме ВОЗ по научным исследованиям и инновациям (11-12 февраля 2020 г.)

1. Andersen KG, Rambaut A., Lipkin WI et al. Проксимальное происхождение SARS-CoV-2. NatMed 26, 450–452 (2020).

2. Muhammad AdnanShereen, SulimanKhan, AbeerKazmi,NadiaBashir,RabeeaSiddique. COVID-19 infection: Origin, transmission, and characteristics of human coronaviruses. Journal of Advanced Researc, July 2020, Pages 91-98July 2020, Pages 91-98

3. Официальный сайт Россельхознадзора

4. Jie Cui, Fang Li, and Zheng-Li Shi. Origin and evolution of pathogenic coronaviruses. NatRevMicrobiol. 2019; 17(3): 181–192.

ВАЖНО!

В свете текущей эпидемиологической ситуации хотим поделиться с Вами основными сведениями о новом коронавирусе, который вызвал вспышку и серьезную обеспокоенность мирового сообщества.

Данная статья подготовлена сотрудниками кафедры инфекционных болезней у детей РНИМУ имени Н.И. Пирогова на основании имеющихся в настоящее время научных данных, с учетом текущей информации Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ), Европейского и Американского центров по контролю за болезнями (ECDC, CDC), Государственного комитета по делам здравоохранения КНР, а также действующих временных рекомендаций Минздрава России и Роспотребнадзора.

КТО ТАКИЕ КОРОНАВИРУСЫ И ОТКУДА ВЗЯЛСЯ COVID-19?

Коронавирусы известны давно. Они способны заражать многие виды животных и человека, вызывая заболевания дыхательных путей или желудочно-кишечного тракта. В естественных условиях коронавирусы имеют строгую видовую принадлежность. Так, например, коронавирусы свиней, вызывают заболевания именно у свиней и не опасны для человека. Заболевания у людей обычно вызывают четыре варианта широко циркулирующих коронавирусов: HCoV-220E, HCoV-OC43, HCoV-NL63 и HCoV-HKU1. Обычно эти варианты вызывают у человека острые респираторные инфекции (ОРВИ) с поражением верхних дыхательных путей. Симптомы не отличаются от других ОРВИ, а болезнь обычно протекает не тяжело.

ПОЧЕМУ К НОВОМУ ВИРУСУ COVID-19 ТАКОЕ ПРИСТАЛЬНОЕ ВНИМАНИЕ И ТАКИЕ СТРОГИЕ ОГРАНИЧЕНИЯ?

НАСКОЛЬКО ВЕРОЯТНА ЭПИДЕМИЯ COVID-19 НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ?

КАК МОЖНО ЗАРАЗИТЬСЯ COVID-19?

Заражение происходит также как и при других ОРВИ – при близком тесном контакте с больным. Вследствие этого опасность представляют люди, имеющие симптомы болезни. COVID-19 обладает низкой устойчивостью во внешней среде, а потому им невозможно заразиться через предметы, которые перемещаются на расстояния, в том числе продукты питания или посылки.

ЧЕРЕЗ СКОЛЬКО ВРЕМЕНИ ПОСЛЕ КОНТАКТА С БОЛЬНЫМ ПОЯВЛЯЮТСЯ СИМПТОМЫ?

Время от заражения до первых признаков болезни (инкубационный период) может составлять от 2 до 14 дней.

КАКИЕ СИМПТОМЫ ПРИ COVID-19?

Симптомы новой инфекции не отличаются от симптомов других ОРВИ. Для инфекции, вызванной COVID-19, характерны лихорадка, кашель, в некоторых случаях возможна диарея. Выраженность симптомов различна. В одних случаях болезнь протекает легко, в других – сопровождается высокой лихорадкой, выраженной слабостью, частым кашлем.

КАК ВОВРЕМЯ РАСПОЗНАТЬ ТРЕВОЖНЫЕ ПРИЗНАКИ БОЛЕЗНИ?

У КОГО ЧАЩЕ НАБЛЮДАЕТСЯ ТЯЖЕЛОЕ ТЕЧЕНИЕ БОЛЕЗНИ?

В большинстве случаев тяжелое течение наблюдается у взрослых и пожилых, особенно, если они имеют сопутствующие хронические заболевания или иммунодефицит. Дети болеют реже, в большинстве случаев переносят легко. Причина этого феномена пока не установлена.

КАК ВЫЯСНИТЬ ЧТО СИМПТОМЫ БОЛЕЗНИ ВЫЗВАНЫ ИМЕННО COVID-19?

Для этого проводится соответствующая лабораторная диагностика (ПЦР). В настоящее время, с учетом эпидемиологической обстановки, COVID-19 исключают у тех, кто находился на территории КНР в последние 14 дней до появления первых симптомов или контактировал с больным (возможным больным) новой коронавирусной пневмонией. Исследование проводится только в специализированных лабораториях Роспотребнадзора или в уполномоченных медицинских учреждениях. Сдать анализ в коммерческой лаборатории нельзя. Реклама подобных услуг является мошенничеством.

КАК ЛЕЧАТ ИНФЕКЦИЮ, ВЫЗВАННУЮ COVID-19?

С учетом действующих временных санитарных мероприятий все больные получают лечение только в стационарах, специализирующихся на лечении таких больных. В городе Москве таким стационаром является Инфекционная клиническая больница №1 (Волоколамское шоссе, дом 63). Эффективность различных противовирусных средств в данный момент изучается. Наиболее достоверный эффект получен от противовирусных препаратов, которые также используются для лечения ВИЧ, вирусного гепатита и гриппа. Также используется сочетание таких препаратов.

НУЖНО ЛИ КУПИТЬ И ЗАПАСТИСЬ ПРОТИВОВИРУСНЫМИ СРЕДСТВАМИ?

Нет, не нужно. Лечение проводят только в стационаре. Решение о выборе подходящего препарата принимает врач.

МОЖНО ЛИ ЗАЩИТИТЬСЯ ОТ COVID-19?

В настоящее время ученые пытаются разработать вакцину против вируса COVID-19. Вакцины против пневмонии, например пневмококковая вакцина или вакцина против гемофильной палочки типа В (Hib-вакцина), не защищают от нового коронавируса. Среди существующих противовирусных средств нет препаратов с доказанной профилактической эффективностью против COVID-19.

Для профилактики рекомендуются следующие меры:

при планировании зарубежных поездок уточнять эпидемиологическую ситуацию;
не посещать рынки, где продаются животные, морепродукты;
употреблять только термически обработанную пищу, бутилированную воду;
не посещать зоопарки, культурно-массовые мероприятия с привлечением животных;
использовать средства защиты органов дыхания (маски);
мыть руки после посещения мест массового скопления людей и перед приемом пищи;
при первых признаках заболевания, обращаться за медицинской помощью в лечебные организации, не допускать самолечения;
при обращении за медицинской помощью на территории РФ информировать медицинский персонал о времени и месте пребывания в КНР.

ВОЗ рекомендует следующие стандартные меры:

регулярно обрабатывайте руки спиртосодержащим антисептиком или мойте их водой с мылом;
при кашле и чихании прикрывайте рот и нос салфеткой или сгибом локтя; тут же выкидывайте салфетку и мойте руки;
держитесь на расстоянии от людей, у которых наблюдается кашель или повышенная температура;
при повышении температуры, кашле и затруднении дыхания как можно скорее обратитесь за медицинской помощью и расскажите медицинскому специалисту о посещенных местах;
посещая места торговли живыми животными в районах, где в настоящее время регистрируются случаи инфицирования новым коронавирусом, избегайте прямого контакта с животными или поверхностями, с которыми они соприкасаются, без использования средств защиты;
не употребляйте в пищу сырые или полусырые продукты животного происхождения. В соответствии с правилами обеспечения безопасности продуктов питания особую осторожность следует проявлять при обращении с сырым мясом, молоком или органами животных во избежание перекрестного загрязнения продуктами питания, не прошедшими термическую обработку.

ГДЕ МОЖНО ПОЛУЧИТЬ ДОПОЛНИТЕЛЬНУЮ ИНФОРМАЦИЮ ПО ПРОФИЛАКТИКЕ ИНФИЦИРОВАНИЯ COVID-19?

Памятка Роспотребнадзора для населения:

ГДЕ МОЖНО ПОЛУЧИТЬ ДОПОЛНИТЕЛЬНУЮ ИНФОРМАЦИЮ О ТЕКУЩЕЙ ЭПИДОБСТАНОВКЕ И ПРИНИМАЕМЫХ МЕРАХ?

Текущая информация Роспотребнадзора:

Текущая информация ВОЗ:

Текущая информация CDC:

Текущая информация ECDC:

ДОПОЛНИТЕЛЬНАЯ ИНФОРМАЦИЯ

Единый консультативный центр Роспотребнадзора:

8 800 555 49 43 (с китайскими и английскими переводчиками)

Круглосуточная информационная линия по вопросам диагностики и профилактики COVID-19 Департамента здравоохранения Москвы:

Мы отвечаем на интересующие вас вопросы в специальном разделе! Чаще всего это вопросы индивидуального характера в отношении вакцинации, иммунитета и тому подобного.

Коронавирусы − это семейство вирусов, вызывающих болезни, начиная от обычной простуды и заканчивая более тяжелыми заболеваниями, такими как тяжелый острый респираторный синдром (ТОРС-КоВ). Новый коронавирус (nCoV) − это новый штамм, который ранее не был идентифицирован у человека.

Коронавирусы являются зоонозными, то есть они передаются между животными и людьми. Детальные исследования показали, что атипичная пневмония передается от цибетовых кошек к людям, а БВРС-КоВ (коронавирус ближневосточного респираторного синдрома) − от верблюдов-дромадеров к людям. Несколько известных коронавирусов циркулируют у животных, которые еще не заразили человека.

Общие признаки инфекции включают респираторные симптомы, лихорадку, кашель, одышку и трудности с дыханием. В более тяжелых случаях инфекция может вызвать пневмонию, тяжелый острый респираторный синдром, почечную недостаточность и даже смерть.

Стандартные рекомендации по предотвращению распространения инфекции включают регулярное мытье рук, закрывание рта и носа при кашле и чихании, тщательное приготовление мяса и яиц. Избегайте тесного контакта с любым человеком, проявляющим симптомы респираторных заболеваний, таких как кашель и чихание.

Для кого наиболее опасна встреча с вирусом?

Особо тяжело переносят инфекцию дети и пожилые люди, для этих возрастных групп очень опасны осложнения, которые могут развиться во время заболевания. Дети болеют более тяжело в связи с тем, что их иммунная система еще не встречалась с данным вирусом, а для пожилых людей, так же как и для людей с хроническими заболеваниями, вирус опасен по причине ослабленной иммунной системы.

Группы риска

Дети
Люди старше 60 лет
Люди с хроническими заболеваниями легких (бронхиальная астма, хроническая обструктивная болезнь легких)
Люди с хроническими заболеваниями сердечно-сосудистой системы (врожденные пороки сердца, ишемическая болезнь сердца, сердечная недостаточность)
Беременные женщины
Медицинские работники
Работники общественного транспорта, предприятий общественного питания

Каким образом происходит заражение?

Инфекция передается от больного человека здоровому через мельчайшие капельки слюны или слизи, которые выделяются во время чихания, кашля, разговора. Возможна и контактная передача.

Скорая помощь, вызов врача
(в т. ч. для забора анализа)

Информационная линия по вопросам
диагностики и профилактики коронавируса (круглосуточно)

Заказать больничный лист, задать вопросы,
сообщить о возвращении из-за границы
(ежедневно, с 08:00 до 21:00)

Когда прошлой зимой коронавирус SARS-CoV-2 ворвался в мир, ученым стало ясно, что дело плохо, но они посчитали, что вирус, по крайней мере, стабилен. Коронавирусы не мутируют так быстро, как, например, вирусы гриппа, гепатита или ВИЧ, — отчасти благодаря системе молекулярного редактирования, которую SARS-CoV-2 и родственные ему вирусы используют для предотвращения злокачественных генетических ошибок при репликации.

Пока что известно, что эти мутации помогают вирусу легче передаваться от человека к человеку и оставаться незамеченным иммунной системой. В январе ученые впервые сообщили, что антитела людей, переболевших COVID-19, не полностью нейтрализуют штамм вируса, обнаруженный в ЮАР. Кроме того, похоже, несколько человек, перенесших COVID-19, повторно заразились мутантным штаммом.

по теме

Эпидемия

Вакцины, антитела, антигены. Гид по иммунологии для чайников

Ниже перечислены пять наиболее значимых штаммов коронавируса в порядке обнаружения учеными. В списке указано место первого выявления каждого из них и официальные названия штаммов или обозначения, используемые исследователями. (Разные группы исследователей используют разные способы обозначения штаммов, что вызвало путаницу. В этом списке использованы наименования, основанные на филогенетическом происхождении штаммов, но некоторые варианты вируса все равно имеют больше одного названия). Также здесь приведены важные мутации каждого штамма (названия мутаций состоят из букв и цифр, обозначающих позицию мутации в геноме вируса) и известная информация о том, что эти мутации делают.

Испания

Штамм 20A.EU1, впервые выделенный в Испании, содержит мутацию A222V в последовательности белка шипа. Шип — структура вируса SARS-CoV-2, которая связывается с рецепторами клеток ACE2 человека, помогая вирусу проникать внутрь этих клеток при заражении. Кроме того, именно с шипами связываются антитела человека, вырабатываемые для иммунного ответа на инфекцию. Лабораторные исследования показали, что человеческие антитела немного менее эффективно нейтрализуют вирусы с мутацией A222V. За несколько месяцев штамм 20A.EU1 стал доминирующим в Европе. Тем не менее эпидемиологи не наблюдали доказательств того, что этот штамм быстрее передается от человека к человеку, чем оригинальный вирус. Исследователи считают, что штамм, который на тот момент доминировал в Испании, распространился по всему континенту, когда в Европе начали ослаблять ограничения на перемещение.

Великобритания

Британские ученые наблюдали за штаммом B.1.1.7 некоторое время, прежде чем объявили в декабре, что он может передаваться как минимум на 50 % активнее, чем вирус дикого типа. Это заявление было основано на эпидемиологических данных, указывающих, что вирус нового штамма быстро распространяется среди населения, и привело к запретам на пересечение границ и усилению карантинных мер в Великобритании.

Штамм B.1.1.7 содержит 17 мутаций, некоторые из них затрагивают белок шипа. Было обнаружено, что одна из этих мутаций, N501Y, помогает вирусу прочнее связываться с рецепторами клеток ACE2. Однако пока неясно, обусловлена ли повышенная контагиозность данного штамма только этой мутацией или еще какими-либо изменениями структуры шипа.

Несмотря на первоначальное беспокойство, не было найдено подтверждений тому, что этот штамм более заразен для детей в сравнении с оригинальным, говорит Шерон Пикок, исполнительный директор Консорциума Великобритании по геномике COVID-19 (COG-UK), группы, анализирующей генетические изменения вируса. И Pfizer, и Moderna считают, что их вакцины от COVID-19 будут работать и против штамма B.1.1.7. Недавние данные из Великобритании указывают на то, что новый штамм может быть более летален по сравнению с диким типом, но это пока только предварительные результаты.

Штамм B.1.1.7 выделяется на фоне других, потому что он накопил так много мутаций. Лоринг и другие исследователи полагают, что эти мутации могли возникнуть при длительном заражении одного пациента с ослабленным иммунитетом, из-за чего организм пациента не мог побороть вирус. По словам Скотта Вивера, микробиолога из медицинского подразделения Техасского университета в Галвестоне, возможно, только некоторые из этих генетических изменений дали штамму эволюционное преимущество и позволили ему быстро распространиться по Великобритании. Остальные мутации просто остались в геноме за компанию.

ЮАР

Штамм B.1.351 появился в поле зрения ученых примерно в то же время, что и британский B.1.1.7. B.1.351 быстро распространился и стал доминантным вариантом вируса в ЮАР. Как и европейский штамм, B.1.351 содержит мутацию N501Y, хотя данные указывают, что два этих штамма возникли независимо друг от друга. Но ученых больше беспокоит другая мутация в африканском штамме, обозначаемая E484K. Это изменение в геноме, возможно, помогает вирусу избегать иммунного ответа и действия вакцин.

Эволюционный биолог и биоинформатик из Онкологического исследовательского центра Фреда Хатчинсона в Сиэтле Джесс Блум с командой с помощью клеток дрожжей создали серию вирусных белков-шипов, содержащих практически все из более 3800 возможных изменений в структуре, которые могут быть вызваны генетическими мутациями. Затем исследователи протестировали, насколько хорошо антитела связывались с каждым из этих видоизмененных шипов. Они обнаружили, что в результате мутации E484K и других похожих мутаций в этом конкретном участке белка антитела некоторых людей в 10 раз хуже связывались с шипами коронавируса. Команда Блума также показала, что некоторые коктейли из антител (подобные коктейли в настоящий момент тестируют фармацевтические и биотехнологические компании Regeneron и Eli Lilly) могут быть менее эффективными при наличии мутаций, которые имеются в штамме B.1.351.

В конце января ученые из ЮАР опубликовали препринт (научная статья, которая еще не прошла независимую рецензию), в котором показали, что сыворотка крови пациентов с COVID-19, содержащая антитела, значительно менее эффективно могла нейтрализовать новый штамм. В другом препринте, опубликованном 26 января, ученые сообщают, что они добавили вирус B.1.351 в сыворотку крови, взятую у людей, которым ранее ввели вакцину производства Pfizer или Moderna. В результате антитела в такой сыворотке проявляли сниженную нейтрализующую активность по отношению к мутантному вирусу в сравнении с вирусом дикого типа.

Однако антитела в пробирке — не то же самое, что вакцина в организме живого человека. В результате применения любой из упомянутых вакцин организм производит столько антител, что даже при сниженной активности их может быть достаточно для нейтрализации вируса. Вакцины также запускают работу других защитных механизмов иммунной системы. Тем не менее Moderna начала разработку бустерной вакцины, специфичной по отношению к новым штаммам.

Бразилия

В январе ученые сообщили об обнаружении двух новых вариантов коронавируса в Бразилии, происходящих от общего предка. Но хотя у этих двух штаммов есть общие мутации с вариантами, обнаруженными в других регионах, по всей вероятности, они возникли независимо.

Из этих двух штаммов ученых больше беспокоит P.1. Он содержит больше мутаций, чем Р.2 (хотя оба штамма имеют мутацию E484K), и уже был обнаружен в Японии и других странах. Возможно, Р.1 накопил свои мутации в организме пациента с ослабленным иммунитетом. Но генетик Эмма Ходкрофт из Бернского университета в Швейцарии говорит, что в этом случае может быть сложнее определить точное время и место возникновения штамма, поскольку в Бразилии секвенируют гораздо меньше образцов вируса, чем в Великобритании.

Ходкрофт отмечает, что в 2020 году и в Бразилии, и в ЮАР были крупные вспышки COVID-19. При таком большом количестве зараженных людей, вырабатывающих антитела к вирусу, штамм, способный избегать распознавания иммунной системой и повторно заражать уже переболевших людей, мог иметь значительное преимущество и широко распространиться в популяции.

Распространение и изменение вирусов

Читайте также: