Принципы компьютерного моделирования молекулярных систем френкель даан смит беренд
Хемоинформатика и Молекулярное Моделирование запись закреплена
Книги для для изучения хемоинформатики, молекулярного моделирования и всего что с этим связано
Вчера в Болталке родилась идея написать пост о хороших книжках для начинающих в области. Как автор, я сам не приветствую пиратство, поэтому сами книги не буду выкладывать, если это не было сделано самими авторами. Но я думаю, вы сможете их найти в сторах или на иных сайтах.
Итак, мой сугубо личный взгляд на лучшие книжки, которые стоит почитать для изучения хемоинформатики, молекулярного моделирования и всего такого. Приведенный порядок книг есть моя субъективная оценка, с чего стоит начать новичку.
Вычислительная химия (книги обо всем)
1. Leach A.R. Molecular modelling: Principles and applications, 2001 - очень просто для новичков. Сразу обо всем в вычислительной химии: про хемоинформатику, и про молдинамику, и про квантовую химию. Не очень подробно, зато понятно.
Область меняется быстро, поэтому самые последние достижения не отражены ни в одной книге. Книг с нормальным описанием structure-based drug design не знаю, к сожалению.
В целом все книги примерно об одном. Но самые модные функционалы и методы выходят за пределы учебников и нигде не описаны.
Тут я не спец и читал мало. Но многие книги по квантовой химии делают реверанс в эту сторону, например, книжка Йенсена, Тихонова и Хинчлиффе.
Предлагаю посоветовать хорошие и не очень старые книжки в комментах (обновлю пост). Мне как-то не повезло найти то, что я хочу, где и про техники расскажут и про статистическую термодинамику.
Машинное и глубокое обучение
1. Camille Wermuth. The Practice of Medicinal Chemistry, 2008. - совсем не учебник, но много полезного.
2. Х.Д.Хёльтье, В. Зиппль, Д. Роньян, Г. Фолькерс. Молекулярное моделирование: теория и практика, 2010 - вроде неплохая книжка, многим нравится. Но когда я был новичком, мне совсем не понравилась.
Здесь собраны учебники, которые, после прочтения, создадут у читателя комплексное понимание целей, задач и методов медицинской химии.
- Graham L Patrick - An introduction to medicinal chemistry-Oxford University Press (2013). Прекрасный учебник для вхождения в предмет медицинской химии и драгдизайна, написан простым и понятным языком, охвачены все основные понятия и концепции. Basic level.
- Camille Georges Wermuth, David Aldous, Pierre Raboisson, Didier Rognan - The Practice of Medicinal Chemistry-Academic Press (2015). Учебник для intermediate уровня. Очень хорошо описаны стратегии оптимизации, методы и кейсы.
- Davis, Andrew M._ Ward, Simon Edward - The handbook of medicinal chemistry _ principles and practice-Royal Society of Chemistry (2015). Эта книга позволит разобраться не только в том, как устроена медхимия, но у читателя сложится полное понимание пайплайна разработки лекарства на каждом из этапов. Intermediate.
Comprehensive Medicinal Chemistry:
-Samuel Chackalamannil, David Rotella, Simon Ward - Comprehensive Medicinal Chemistry III (2017, Elsevier). Монументальный труд по медхимии, включающий в себя не только общие концепции и понятия, но и огромное количество кейсов. Advanced.
John B. Taylor and David J. Triggle, - Comprehensive Medicinal Chemistry II (2006)
-Jie Jack Li - Medicinal Chemistry for practitioners (2020). Самая новая книга в списке, наглядная и понятная. Обилие кейсов под каждый из тезисов.
Debarshi Kar Mahapatra, Sanjay Kumar Bharti - Handbook of Research on Medicinal Chemistry_ Innovations and Methodologies-Apple Academic Press (2016)
Предлагаю делиться в комментариях своими предложениями новичкам, вставлю в пост.
Читайте также: